Dışarıdan girdiÄŸi Doçentlik sınavlarını kazanarak 23 Kasım 1963 tarihinde Üniversite Doçenti unvanını alan Doç. Dr. Hakkı Bilgehan, baÅŸvurduÄŸu Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Ä°ntan Hastalıkları Kürsüsü Doçentlik kadrosuna naklen atanmıştır (28 Ocak 1964). Doç. Dr. Bilgehan, 14 Ocak 1969 tarihinde ProfesörlüÄŸe yükseltilmiÅŸtir. Ä°ngiltere´de Porsmouth Saint Marys Hospital ve Glasgow University Rachill Hospital´de misafir öÄŸretim üyesi olarak viroloji üzerinde çalışmalar ve araÅŸtırmalarda bulunmuÅŸtur (25 Aralık 1969 – 30 AÄŸustos 1970).

Prof. Dr. Hakkı Bilgehan, Tıp Fakültesi Yönetim Kurulu üyeliÄŸi (02 Kasım 1966 – 02 Kasım 1968), Mikrobiyoloji ve Ä°ntan Hastalıkları Kürsüsü BaÅŸkanlığı (01 Haziran 1973 – 27 Åžubat 1979), Klinik Mikrobiyoloji ve Mikrobiyoloji Anabilim Dalı BaÅŸkanlığı (1989-1992) ve Temel Tıp Bilimleri Bölüm BaÅŸkanlığı (24 Temmuz 1990 – 01 Temmuz 1993) görevlerinde bulunmuÅŸ, kurucularından biri olduÄŸu ve ek görevle atandığı Eczacılık Fakültesi´nde  öÄŸretim üyeliÄŸi ve Yönetim Kurulu ÜyeliÄŸi yapmıştır.07 Kasım 1974 – 06 Haziran 1977 tarihleri arasında Üniversite Senatosu ve aynı zamanda Üniversitelerarası Kurul üyeliklerinde bulunmuÅŸtur.

Prof. Dr. Bilgehan, 08 Temmuz 1972 tarihinde seçildiÄŸi EÜ Tıp Fakültesi Dekanlığı’nda 07 Kasım 1974 tarihine kadar ve 06 Haziran 1977 tarihinde Ege Üniversitesi’nin 7. Rektörü olarak seçildiÄŸi görevde 02 Ekim 1980 tarihine kadar hizmet vermiÅŸtir. Bu görevleri esnasında üniversitemizin ilk anaokulu olan Tıp Fakültesi Anaokulu (1973) ile Ege Üniversitesi Anaokulu ve KreÅŸi’nin kurulmasına öncülük etmiÅŸtir.

Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti, Ankara Mikrobiyoloji DerneÄŸi ve Türkiye Parazitoloji DerneÄŸi üyesi olan  Prof. Dr. Bilgehan, bilimsel alanı ile ilgili olarak 6 kitap, 5 kitap bölümü ve bazılarının editörlüÄŸünü yapmıştır. Ayrıca çok sayıda bilimsel makale ve tebliÄŸi bulunan, Ä°ngilizce, Almanca ve Yunanca bilen Prof. Dr. Hakkı Bilgehan, 01 Temmuz 1993 tarihinde yaÅŸ haddinden emekli olmuÅŸtur.

Prof. Dr. Hakkı Bilgehan, 2003-2005 yılları arasında dönemin Ege Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Sayın Ülkü Bayındır´Ä±n ricası ve görevlendirmesi ile "KuruluÅŸundan Günümüze Ege Üniversitesi" adlı kitabın yazarları arasında yer almıştır.